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（一）免疫因素 １． 细胞免疫异常：例如有人在复发性口疮溃疡部分分离出了腺病毒，且在患者体内和循环免疫复合物（CIC）中发现了单纯疱疹病毒（HSV-1）的DNA。还有人采用免疫组化法，发现在溃疡前期溃疡发作期和间歇期，CD3(总Ｔ淋巴细胞)、CD4(T辅助细胞)、CD8(T毒性细胞)以及CD４：CD8均有不同程度的异常变化。证实了T淋巴细胞及其亚群之间的构成关系失去平衡介导了免疫应答反应。又如：有人对患者外周血用3H-TdR掺入法检测PHA诱导的淋巴细胞增殖能力表明，患者的Ｔ淋巴细胞增殖能力显著低于健康人对照组等等。 ２． 体液免疫异常和自身免疫：虽然目前还缺乏该病是自身免疫性疾病的有力证据但抗口腔黏膜抗体的存在和CIC、ADCC以及棘细胞胞浆中发现的自身抗体都说明体液免疫和自身免疫反应是发病的可能因素之一。 ３． 免疫功能低下和免疫缺陷：有人证实患者的淋巴细胞对PHA和刀豆蛋白的反应在溃疡各个阶段都比健康人低下。用胞腺病毒作抗原刺激机体时，复发性口疮患者的刺激反应亦属低下。HIV感染的患者病情往往较重。说明该病可能与免疫功能低下或免疫缺陷有关。 （二） 遗传因素
单基因遗传、多基因遗传、遗传标记物和遗传物质的研究表明，复发性口疮的发病有遗传倾向。
家族系谱分析法是单基因遗传病重要诊断依据有人对6个家族4代人318人的患病情况进行分析，发现复发性口疮发病第一代为23.3%,第二代为39.9%，第三代为40%，第四代为39.4%，另外有人对复发性口疮患者子女中的复发性口疮患病率进行了调查，总患病率为47.9%。男性为47.6%，女性为48.3%，男女性别无差别，说明复发性口疮虽有明显的家族性。
流行病学调查是确定多基因遗传病的重要手段。多基因遗传病受遗传和环境二种因素制约。其综合指标是遗传度。遗传度越大，遗传因素影响越大。有人对沈阳地区3714人进行流行病学调查，计算RAU遗传度为75%,与唇腭裂遗传度76%几乎相等，仅次于精神分裂症(80%)的遗传度。此外，国内学者发现父母均无复发性口疮，其子女发病的可能性为12%~29%，父母一方患复发性口疮的子女发病率为30%~45%，父母均患复发性口疮的子女发病率为62%~67%，而国外学者的研究结果也与此相近。说明该病是一种多基因遗传病。人类白细胞抗原（HLA）是重要的遗传标记物。HLA基因与免疫应答基因(Ir)相连锁，因此通过寻找HLA与Ir连锁的不平衡规律可能发现HLA在该病发病中的作用。对复发性口疮患者血液中的HLA基因产物——HLA抗原的研究表明，患者携带HLA-A２、B12、B5、AW29的频率明显高于健康人。
染色体是遗传物质的载体，微核是染色体断片在细胞分裂过程中形成的一种核外遗传物质。微核黄素出现率反映染色体脆性大小。研究发现复发性口疮患者微核率较健康人高，且与溃疡数目有一定关系。患者的染色体结构畸变率、分布及类型在亲子两代均与健康人有明显不同。说明染色体结构畸变与脆性增加对该病发病有影响。 （三） 系统性疾病因素
临床实践经验和流行病学调查发现复发性口疮与胃溃疡、十二指肠溃疡、溃疡性结肠炎、局限性肠炎、肝炎、肝硬化、胆道疾病有密切关系。有人对30例复发性口疮患者作胃镜检查，发现10例食道、胃、十二指肠存在与口腔溃疡相似的浅表性散在小溃疡。有12例伴慢性浅表性胃炎。有人报道腹胀、腹泻、便秘等消化道功能紊乱约占复发性口疮患者发病诱因的30%。
内分泌系统的疾病如糖尿病、月经紊乱等也与复发性口疮有一定关系。有人用放射免疫法监测女性患者血清中孕酮含量，结果显示孕酮含量明显降低，用甲孕酮口服3个月后症状明显好转。临床初中也发现某些女性患者发病与月经周期有密切关系，妊娠期和哺乳期病情好转。说明内分泌紊乱可能是该病的一种发病因素。 （四）感染因素
有人用PCR技术检测62例复发性口疮患者口腔脱落上皮细胞的人类巨细胞病毒（HCMV）的DNA，阳性率达46.8%，与健康人对照组阳性率3.6%相比有显著性差异。还有人对283例患者行结核菌素试验，结果73.5%阳性，67.3%抗结核抗体阳性。提供了感染因素的证据。 （五） 环境因素
包括心理环境、生活工作环境、社会环境等。大量精神神经方面的研究表明，复发性口疮患者Ａ型行为类型问卷得分高于健康人；回顾发病1年内几乎人人都有明显的重要生活事件存在。有人对男性复发性口疮患者的好发月份进行调查，发现好发月份与气候环境呈正相关。对学生的调查发现考试前复发率明显上升。对职业人群的调查发现更换工作岗位，工作环境变迁等时期容易复发。国外有人对复发性口疮患者常用的12种食物添加剂进行斑贴试验，20/21有对被试食物的阳性反应，避免食用这些食物后，18/20的临床症状得到改善，说明食物与复发性口疮有很大关系。此上，研究表明食物中缺乏锌、铁、硒等元素锌/铀比值增高，或B1、B2、B6、叶酸等摄入不足，均与复发性口疮发病有一定的相关性。 （六） 其他因素
1、超氧化物歧化酶（SOD）：国外研究表明复发性口腔患者SOD活性有下降趋势，而过氧化脂（LPO）水平明显升高，说明体内超氧自由基的生成和清除率不平衡与发病有关。
2、血栓素B2(TXB2)和6酮前列腺素F1a(6K-PGF1a)：有人采用放射免疫法测定复发性口疮患者血浆中TXB2和6K-PGF1a，发现两者均明显低于健康人对照组，且6K-PGF1a下降幅度更大。推测两者比例失调和总体水平下阡与血管内皮细胞损伤有关，从而导致复发性口疮。
3．微循环：对复发性口疮患者的甲皱、舌尖、唇黏膜等部位的微循环观察发现，患者毛细血管静脉端曲张，丛数变少，管袢形态异常，血流速度减慢，血流量减少。血液流变研究显示血粘度增高等改变。运用中医辩证分型结合微循环检测发现气虚型、血瘀型、血热型等在微血管流态、血管形态、轮廓、血色、管周渗血、出血点、乳头下静脉丛显露等项目有不同的改变，分别运用补气、活血、清热等不同中药后，症状随微循环改善好转而减轻，证实微循环障碍与该病发病有关。
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